Vias de investigação da contaminação e transmissão do Enterococcus (VRE) resistente à vancomicina em unidades de terapia intensiva: um estudo prospectivo de vigilância genômica
PreprintInfectologiaPré-publicação. Ainda não revisada por pares; não deve orientar conduta.
O que aconteceu
Espécies de Enterococcus (VRE) resistentes à vancomicina são agentes patogénicos comuns associados aos cuidados de saúde que causam infecções de difícil tratamento. O sequenciamento total do genoma dos pacientes revelou uma carga substancial de transmissão do VRE do paciente para o paciente em hospitais, com pacientes em unidades de terapia intensiva (UCI) em risco particularmente elevado de aquisição. Entretanto, poucos estudos caracterizam adequadamente as vias de transmissão do VRE entre pacientes em ambientes de cuidados agudos - passo necessário para identificar lacunas atuais nas práticas de prevenção de infecções. Aproveitando análises genômicas de agrupamento de sequências de genomas inteiros de isolados de VRE de pacientes, superfícies ambientais e prestadores de cuidados de saúde (HCP) em UTIs, objetivamos reconstruir vias indiretas de movimento de patógenos para identificar padrões de propagação de VRE e oportunidades de prevenção de transmissão.
O que encontraram
Foram coletadas amostras diárias (N = 6848) de UTIs em dois hospitais durante 13 semanas de quatro principais fontes de amostragem: pacientes, mãos HCP, salas de pacientes e superfícies compartilhadas. As amostras foram cultivadas em meios seletivos e enviadas para sequenciamento do genoma inteiro (WGS). Utilizamos limiares genômicos para identificar clusters de isolados relacionados de VRE e distinguir isolados não relacionados. O VRE foi detectado em amostras de 20 de 322 ocupantes únicos (6,22%). Os isolados de VRE foram detectados de todas as fontes de amostragem, exceto para superfícies compartilhadas. Foram identificados 44 isolados únicos de VRE, 43 de Enterococcus faecium (VREfm) e um de Enterococcus faecalis (VREf). Foram observados dois padrões distintos de propagação do VREfm: 1) um quadro de surto com transmissão paciente-paciente observada e baixa heterogeneidade genômica do VRE, e 2) alta heterogeneidade genômica do VRE e movimento patogênico entre ocupantes facilitados por HCP persistente e contaminação ambiental, mas sem eventos de transmissão observados. As probabilidades de detecção de VRE não foram significativamente diferentes entre os períodos de permanência do ocupante no surto e as configurações de não fuga (OR = 0,63, IC 95% (0,23; 1,83), p = 0,32). No entanto, a inclusão de isolados de VRE de amostras não-pacientes aumentou o número de ocupantes com detecção de VRE de 6 para 20, um aumento de 3,3 vezes, em comparação com amostras de pacientes isoladamente. Incluindo amostras não-pacientes também aumentou o número de clusters genômicos multi-isolados VRE detectados em 7 vezes. Nossos achados são limitados porque a amostragem foi realizada principalmente em UTIs. Devido à combinação de curta permanência na UTI e sensibilidade ao teste imperfeito, os eventos de transmissão do VRE podem ter sido pouco detectados.
Por que isso importa
Nossos achados caracterizam a natureza complexa das vias de transmissão do VRE em ambientes de UTI. Mesmo sem um surto contínuo, encontramos evidências substanciais de movimento de VRE entre ocupantes-estadias, facilitados por uma combinação de mãos HCP e superfícies ambientais. Este estudo destaca a importância da amostragem ambiental para o entendimento do potencial de transmissão do VRE, que provavelmente será subestimado utilizando apenas a amostragem do paciente. Recomenda-se que futuros estudos incorporem amostra de seguimento após a alta para melhor compreender a verdadeira carga de transmissão.
Tradução automática do resumo original, publicado em medRxiv sob licença CC BY. Os números são conferidos contra o original; siglas e termos técnicos podem variar.
O estudo original
Investigating pathways of vancomycin-resistant Enterococcus (VRE) contamination and transmission in intensive care units: a prospective genomic surveillance study
Tierney O’Sullivan, Windy D. Tanner, William J. Brazelton, Karim Khader, Candace Haroldsen, Brian Orleans, Matthew H. Samore, Michael Rubin, Lindsay T. Keegan