Um recurso proteômico e histológico clinicamente anotado de 1.000 cânceres colorretais

O que aconteceu

O câncer colorretal (CRC) é heterogêneo, mas as classificações atuais captam essa heterogeneidade apenas em parte. Aqui apresentamos um recurso multimodal de 1.000 casos de CCR sem tratamento, a maior coorte de CCR com perfil proteomicamente maior até o momento, integrando proteômica profunda, genômica direcionada, histopatologia total e acompanhamento clínico. Do proteoma derivamos seis subgrupos que recapitulam as classes MSI e mesenquimal, resolvem a classe cromossômica instável em três subgrupos funcionais, incluindo um subgrupo indolente com desfecho favorável, e identificam um subgrupo raro, previamente não reconhecido, com desfecho adverso. Os subgrupos estão associados à evolução clínica, à sobrevivência associada à quimioterapia, às mutações condutoras e à resposta predita ao fármaco. Por serem definidos por programas multiproteicos coordenados, sua atribuição requer classificação multiproteica em vez de marcadores únicos e transferências para uma coorte independente. A coleção de imagens inteiras deslize que acompanha estabelece referências para inferir subgrupos proteômicos da morfologia. Todos os dados são liberados como referência aberta para estratificação funcional do CCR e patologia computacional.