ResponseVerdict anula assinaturas de imunoterapia validadas computacionalmente, recupera seus respondedores perdidos e supera todos os preditores de resposta publicados

O que aconteceu

Assinaturas de resposta de bloqueio de pontos de controle imunológicos são validadas contra TIDE e outras ferramentas computacionais. Em 2.045 pacientes tratados, 1.566 assinaturas de 1.235 artigos não têm capacidade de predizer resposta (AUC 0,515) e seguir todos os cinco escores imunológicos publicados anos antes deles; uma mediana 44% dos conjuntos de genes aleatórios passam por esta validação. Os escores de risco ajustados para sobrevivência foram renomeados preditores de resposta, e TIDE, lendo os anticorpos T esgotados PD-1 alvo como imunidade falhada, orientado 994 de 1.524 assinaturas para rotular como não respondedores os tumores imuno-infiltrados que respondem mais frequentemente. Essas assinaturas chegaram ao banco e à clínica: 376 de 392 experimentos em sinais de células imunes ou estromais foram realizados em outras células, e uma regra de baixo escore define a elegibilidade em um ensaio randomizado. ResponseVerdict orienta e seleciona os escores pela resposta medida em outras coortes tratadas. Utilizando apenas dados públicos antes de cada alvo, ele eleva o AUROC sobre o TIDE em 0,14 e é significativamente melhor do que preditores publicados, escores imunológicos e programas de aprendizagem em 1.178 de 2.000 comparações pareadas e piores em nenhum; adiciona 16,2 respondedores por 100 slots de matrícula sobre as assinaturas dos autores em 2.179 pacientes, 9,5 sobre o GEP18 utilizando apenas dados públicos mais adiantados e 10,2 sobre o TIDE em uma coorte intocada pontuada cega para o desfecho, e, alocando tratamento em todos os 14 estudos de imunoterapia randomizados públicos de estudos anteriores, excedeu todos os programas avaliados nos mesmos ensaios, somando 67,3 meses livres de progressão por 100 pacientes sobre alocação aleatória.