Reorganização fenotípica-nuvem forma progressão do câncer e adaptação terapêutica

O que aconteceu

Os tumores compreendem estados fenotípicos heterogêneos, mas como esses estados são reorganizados durante a progressão maligna e a adaptação terapêutica permanece pouco compreendida. Aqui integramos dados transcriptômicos espaciais, unicelulares, proteômicos espaciais, transcritos em massa e perturbadores para examinar a progressão do câncer de mama como uma nuvem fenotípica inserida em tecido. Uma coordenada de progressão derivada da rede grafo-neural combinada com Field--Flow--A análise frontal revelou transições reprodutíveis entre regimes organizacionais distintos. A progressão passou por um estado intermediário fragmentado e de alta mistura antes de se estabilizar em uma Frente remodeladora de interfaces, acompanhada pela dissociação de programas proliferativos/receptores de programas de motilidade e matriz extracelular. Esta proliferação - transição de invasão foi recuperada através de sistemas moleculares, proteicos e funcionais independentes, enquanto tecido mamário normal não tinha estabilização comparável. O perfil de dependência genética de linhas cruzadas ligava ainda mais esta arquitetura de estado a uma integração recorrente -- adesão centrada em FAK -- vulnerabilidade à mechanotransdução através de tumores sólidos. A quimioterapia eliminou seletivamente a nuvem do fenótipo pré-tratamento, enriquecendo repetidamente um conjunto restrito de estados sobreviventes fenotipicamente convergentes apoiados por diversas vias transcricionais e regulatórias. Análises de perturbação e dependência do pan-câncer mostraram ainda que essa degenerescência molecular poderia coexistir com convergência parcial em uma arquitetura de aptidão compartilhada. A acessibilidade a esses fenótipos compatíveis com sobreviventes foi parcialmente codificada antes do tratamento em uma arquitetura multidimensional de competência que se generalizou em sistemas experimentais e coortes clínicas. Em conjunto, esses achados identificam transições fenótipo-nuvem como uma característica organizacional da progressão do câncer e adaptação terapêutica, e sugerem que distintas restrições seletivas podem canalizar estados tumorais molecularmente diversos para um repertório restrito de soluções fenotípicas e funcionais.