O papel da regulação epigenética mediada por R-loops na manutenção da estabilidade do genoma e patogênese da doença: uma revisão sistemática

O que aconteceu

Esta revisão sistemática sintetiza as evidências atuais ligando R-loops - processos associados com regulação epigenética, estabilidade do genoma e doença humana, integrando achados através de modificações de DNA/RNA/proteína e organização do genoma 3D, e destacando as principais lacunas mecanicistas e técnicas relevantes para estudos futuros, incluindo a exploração translacional de longo prazo. Seguindo as diretrizes PRISMA (Registro n.o: INPLASY202560055), as bases de dados PubMed e ScienceDirect foram pesquisadas até 18 de janeiro de 2026. Dois revisores independentes realizaram triagem cega via plataforma Rayyan. Dos 1290 artigos iniciais, 71 estudos atenderam aos critérios de inclusão. O rigor metodológico foi avaliado utilizando-se uma ferramenta modificada do SYRCLE risk-of-bias. A síntese temática identifica R-loops como intermediários recorrentes que ligam transcrição, regulação da cromatina e manutenção do genoma; relações tipo feedback são relatadas em sistemas selecionados. Eles impedem espacialmente DNMTs para sustentar a hipometilação promotora enquanto recrutam enzimas TET para desmetilação, e modificações de RNA (por exemplo m5C/m6A) podem sintonizar a estabilidade híbrida e, em alguns contextos, influenciar o recrutamento efetor. R-loops facilitam o recrutamento de complexos modificadores de histona (PRC1/PRC2, G9a/GLP), influenciando assim paisagens de cromatina e arquitetura do genoma 3D - incluindo associações com isolamento de fronteira TAD e com compartimentos de reparo relacionados com LLPS em contextos específicos. Disregulação da homeostase R-loop liga-se a alterações epigenéticas relacionadas à doença e instabilidade do genoma com distintas especificidades do estado da doença, locus e células, e seus papéis dependentes do contexto em diversas desordens envolvem silenciamento transcricional, dano ao DNA, conflitos de transcrição-replicação, vias de reparo, regulação da cromatina e manutenção do genoma mitocondrial. Integrar o DRIP-seq com perfis epigenômicos e testes funcionais suporta o mapeamento de relações específicas do contexto.