Meta-Análise dos Efeitos da Desprivação Aguda do Sono no Transcriptoma Cortical em Modelos Roedores

O que aconteceu

A privação do sono (DP) causa grandes distúrbios no humor e cognição. A base molecular para estes efeitos pode ser explorada usando o perfil transcricional para quantificar a expressão do gene cerebral. Neste relatório, utilizamos uma metanálise de dados de perfis transcricionais públicos para descobrir efeitos do SD na expressão gênica que são consistentes entre estudos e paradigmas. Para a realização da meta-análise, foram utilizados termos de busca pré-especificados relacionados aos paradigmas de SD de roedores para identificar estudos relevantes dentro de Gemma, um banco de dados contendo dados de microarray reanalisado > 19.000 e RNA-Seq. Oito estudos atenderam aos critérios sistemáticos de inclusão/exclusão. Estes estudos caracterizaram o efeito de 18 intervenções SD na expressão gênica no córtex cerebral do ratinho (coletivo n = 293). Para cada gene com dados suficientes (n = 16.290), cabemos um modelo de meta-análise de efeitos aleatórios aos tamanhos de efeito SD (log(2) alterações de dobra). Nossa meta-análise revelou 182 genes diferencialmente expressos em resposta ao DP (falsa taxa de descoberta: FDR < 0,05), a maioria dos quais (115/182) mostrou efeitos semelhantes (FDR < 0,05) em um conjunto de dados grande independente (GSE114845: n = 86 amostras de RNA-Seq de n = 222 camundongos). A análise de enriquecimento de genes revelou uma diminuição da regulação nas vias relacionadas com a resposta ao stress (p. ex., receptor de glucocorticóides Nr3c1), vasculatura, crescimento e desenvolvimento, e aumento da regulação relacionada com o stress, inflamação e sinalização de neuropeptídeos. Análises exploratórias sugeriram que o sono de recuperação (incluído em seis contrastes: intervalo: 1-18 h) poderia reverter o impacto do DP na expressão gênica. Nossa meta-análise fornece uma base de dados de referência útil que ilustra o impacto molecular diversificado do SD no córtex cerebral de roedores.