Localização citoplasmática de 5hmC revela hidroximetilação de RNA no câncer de mama

O que aconteceu

A metilação do DNA (5-metilcitosina, 5mC) é uma grande marca epigenética repressiva que pode ser iterativamente oxidada por dez-eleveno-translocação (TET) enzimas para 5-hidroximetilcitosina (5hmC); além do DNA, as modificações do RNA também podem afetar a estabilidade transcriptacional e processamento, mas a hidroximetilação do RNA permanece inexplorada no câncer de mama (BC). Aqui, identificamos um sinal citoplasmático quantificável de 5hmC em linhas celulares CB e, mais proeminentemente, em tecido CB humano, utilizando imunoensaios e patologia digital, e confirmamos com um ELISA adaptado, sensível à RNase, específico ao RNA que este sinal reflete hidroximetilação do RNA total e mRNA. Citoplasmático 5hmC foi significativamente enriquecido em triplo negativo (ER-/PR-/HER 2-) e tumores de grau 3, e correlacionados com aumento do TET2/TET3 citoplasmático em tecido e aumento do TET3 em TCGA. Como principal mecanismo candidato, a expressão do TET3 foi associada a transcrições RNA-processamento/espliceosoma, e a nocauteamento do TET3 em três linhagens celulares TNBC reduziu um subconjunto desses alvos, independentemente suportadas em 70 linhas de câncer de mama DepMap.