Impacto da poluição do ar e fumaça de tabaco na paisagem de RNA não codificadora placentária

O que aconteceu

O desenvolvimento fetal é altamente sensível às influências ambientais, incluindo o tabagismo materno durante a gravidez (MSDP) e a poluição atmosférica. A placenta pode desempenhar um papel central na mediação destes efeitos através de mecanismos epigenéticos, incluindo pequenos RNAs não codificadores (SncRNAs). Enquanto a maioria dos estudos se concentraram em microRNAs (miRNAs), outras classes de sncRNA permanecem mal caracterizadas. Aqui, caracterizamos a paisagem do sncRNA placentário e investigamos suas associações com a exposição pré-natal à MSDP e à poluição atmosférica. O perfil de expressão do sncRNA de 390 amostras de vilosidades coriônicas do Barcelona Life Study Cohort (BiSC) foi medido usando o sequenciamento de RNA pequeno e o pipeline seqBuster/seqCluster. A MSDP foi avaliada por meio de questionário, e a exposição pré-natal ao carbono negro (BC), material particulado [≤]2,5 m (PM2.5) e dióxido de nitrogênio (NO2) foi estimada por meio de modelos espatiotemporais híbridos de dispersão-uso de terra (URL). As associações foram avaliadas utilizando regressões lineares ajustadas para covariáveis relevantes. Foram identificados 979 clusters de sncRNA placentário, atribuídos principalmente aos miRNAs (33,2%), piRNAs (26,4%), snoRNAs (12,2%), tRFs (7,8%) e outros (20,4%). O MSDP foi associado com a regulação descendente do miR-421 e a regulação ascendente de múltiplos snoRNAs do locus DLK1-DIO3 impresso (SNORD113-4, SNORD114-2, SNORD114-3 e SNORD114-17), bem como o piR-26394. Nenhum sncRNA permaneceu significativamente associado à poluição do ar após a correção de múltiplos testes, embora vários miRNAs tenham apresentado associações sugestivas. De modo geral, este estudo fornece uma caracterização abrangente dos RNAnc placentários e identifica sncRNAs previamente não relatados associados ao tabagismo dentro do locus impresso DLK1-DIO3, ampliando nosso entendimento das respostas epigenéticas placentárias às exposições ambientais pré-natais.