Detecção de merbecovírus em morcegos dinamarqueses utilizando um novo ensaio RT-qPCR de largo alcance

O que aconteceu

Os merbecovírus associados ao morcego compreendem um grupo geneticamente diversificado de coronavírus com uso variável de receptores e faixa hospedeira, destacando a necessidade de ferramentas eficientes para sua vigilância. Aqui, desenvolvemos e otimizamos um teste quantitativo de transcrição reversa de PCR (RT-qPCR) para detecção de merbecovírus associados ao morcego, incluindo a linhagem previamente identificada em morcegos pardos de orelhas longas (Plecotus auritus) na Dinamarca. Análise in silico previu a detecção de 898 de 941 (95,4%) sequências de merbecovírus, e o ensaio detectou todos os merbecovírus associados ao morcego incluídos no painel experimental. O ensaio foi aplicado a 33 morcegos amostrados através do programa nacional de vigilância de morcegos dinamarquês em 2025. O RNA do Merbecovírus foi detectado em duas amostras, uma de um P. auritus e uma de uma pipistrelle de Nathusius (Pipistrellus nathusii), representando a primeira detecção de um merbecovírus em P. nathusii na Dinamarca. O sequenciamento metagenômico da próxima geração recuperou um genoma completo do merbecovírus da amostra de P. nathusii. A análise filogenética atribuiu o vírus ao clado MOW e mostrou que ele estava intimamente relacionado com o vírus russo MOW15-22, compartilhando 98,67% identidade nucleotídeo em todo o genoma completo e 99,85% identidade de aminoácidos na proteína pico. Os dados de sequência limitados obtidos da amostra de P. auritus foram consistentes com a linhagem de merbecovírus anteriormente identificada nesta espécie na Dinamarca. Em conjunto, esses achados demonstram a utilidade de RT-qPCR de amplo alcance combinado com sequenciamento metagenômico para vigilância e caracterização genômica de merbecovírus associados ao morcego.