Análises de randomização e colocalização mendelian de transcriptoma de células únicas revelam mecanismos imunoespecíficos e alvos de drogas acionáveis no câncer de próstata

O que aconteceu

O câncer de próstata continua sendo uma grande carga de saúde com sucesso limitado em terapias imuno-alvo. Para identificar alvos geneticamente priorizados por células imunes, integramos dados de cis-eQTL unicelulares em 14 tipos de células imunes, eQTLs a granel, estatísticas sumárias de GWAS de PRÁTICA e FinnGen e dados de RNA-seq unicelulares de tumores de próstata. Utilizando a randomização mendelian e a colocalização bayesiana, priorizamos 80 associações do tipo eGene-cell apoiadas tanto pela associação genética quanto pela evidência de sinal compartilhado, com representação proeminente em CD4+ e CD8+. Subconjuntos de células T. As análises funcionais revelaram enriquecimento em vias imunes, como processamento de antígenos e sinalização de citocinas. Metanálise identificou 52 associações do tipo eGene-cell nominalmente significativas envolvendo 25 genes únicos. A transcriptômica de uma única célula mapeou ainda mais a expressão de genes priorizados, incluindo HLA-DQA2, TXN e COX6B1, através de populações imunes dentro do microambiente do tumor de próstata. O mapeamento fármaco-alvo destacou conexões farmacológicas candidatas envolvendo genes como IGF1R e FAAH, com interações medicamentosas conhecidas mapeadas via DrugBank e STRING. Nosso arcabouço integrativo identifica associações genéticas resolvidas por células imunes com a suscetibilidade ao câncer de próstata e prioriza alvos candidatos para investigação mais funcional e farmacológica. Esses achados fornecem um recurso de alta resolução para estudar mecanismos imunes a tumores geneticamente informados e hipóteses terapêuticas no câncer de próstata.